حكومت ولايي (چاپ پنجم، مهر 1387 – همراه با تصحیح تازه)
2 انديشه سياسي در اسلام
نشر ني
نظريه‌هاي دولت در فقه شيعه (چاپ هفتم، مهر 1387)
انديشه سياسي در اسلام 1
نشر ني
سیاست نامۀ خراسانی (چاپ دوم، اردیبهشت 1387)
قطعات سیاسی در آثار ملا محمد کاظم خراسانی صاحب کفایه (1329 – 1255ق)
مجموعه اسناد پیشگامان اسلام سیاسی در ایران معاصر-1
انتشارات کویر
دفتر عقل (چاپ دوم، 1387)
مجموعه مقالات فلسفي كلامي
انتشارات اطلاعات
——————-
کتاب جدید کدیور نیز منتشر شده است:
حق الناس: اسلام و حقوق بشر
انتشار کتاب جدید کدیور، نشر کویر، 436 ص، مهر 87